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Lehrende/r: Univ.-Prof. Dr. Miguel Andrade; Dr. Anne Bicker; Univ.-Prof. Dr. Susanne Foitzik; Univ.-Prof. Dr. Susanne Gerber; apl. Prof. Dr. Maria Griebeler; Univ.-Prof. Dr. Thomas Hankeln; Sören Lukas Hellmann; apl. Prof. Dr. Elmar Jaenicke; Univ.-Prof. Dr. Martin Kaltenpoth; apl. Prof. Dr. Bernhard Lieb; Dr. Florian Menzel; Carina Osterhof; HD Dr. Michael Schaffeld; Dennis Seiwert
Veranstaltungsart:
Übung
Anzeige im Stundenplan:
10.026.042.Ü
Semesterwochenstunden:
3
Unterrichtssprache:
Deutsch
Min. | Max. Teilnehmerzahl:
- | 180
Voraussetzungen / Organisatorisches:
Für die Teilnahme an den Veranstaltungen in Modul 4-2: Biostatistik und Bioinformatik müssen Modul 4-1: Mathematik und Statistik erfolgreich abgeschlossen und die Veranstaltungen in Modul 8: Genetik bereits absolviert sein. Bei Studienbeginn im WiSe wird Modul 4-2: Biostatistik und Bioinformatik in der Regel bereits im 4. Fachsemester belegt. Bei Studienbeginn im SoSe kann dieses Modul jedoch erst im 5. Fachsemester absolviert werden.
Die Veranstaltung wird wegen Corona nur in digitaler Form ohne Präsenzzeiten auf dem Universitätsgelände im Zeitraum vom 24.08.-04.09.2020 stattfinden. Am Mi., den 26.08.2020 pausiert die Veranstaltung wegen der Klausur in Pflanzenphysiologie, damit Anreiseprobleme für die Klausur vermieden werden. Dafür wird am Mo., den 24.8.2020 von 13.00-16.00 Uhr die Veranstaltung auch nachmittags stattfinden. Die online-Veranstaltungszeiten lauten:
Mo., 24.08.2020, 08.15-12.00 + 13.00-16.00 Uhr
Di., 25.08.2020, 08.15-12.30 Uhr
Do., 27.08.2020, 08.15-12.30 Uhr
Fr., 28.08.2020, 08.15-12.30 Uhr
Mo., 31.08.2020, 08.15-12.30 Uhr
Di., 01.09.2020, 08.15-12.30 Uhr
Mi., 02.09.2020, 08.15-12.30 Uhr
Do., 03.09.2020, 08.15-12.30 Uhr
Fr., 04.09.2020, 08.15-12.30 Uhr
Anmerkung: Die Übungszeiten beinhalten auch die Zeiten der Vorlesung. Trotzdem ist eine separate Anmeldung für die Vorlesung (Veranstaltung: VL Biostatistik / Bioinformatik, 10.026.042.VL) erforderlich.
Inhalt:
- Einführung und Anwendung bioinformatischer Methoden in der Genomforschung: Gen- und Genomstruktur, DNA-Sequenzierungsmethoden, Bewertung und Editieren von DNA-Sequenzen, DNA- und Protein-Sequenzalignment, Sequenzdatenbanken und Suchalgorithmen, Generkennung und –annotation, Genombrowser
- Molekulare Phylogenie: Datenerhebung, Multiples Sequenzalignment, Evolutionsmodelle, Methoden der Stammbaum-Rekonstruktion
- Proteinstruktur und Domänen, Proteinstrukturdatenbanken, Protein-Interaktionen
- Einführung und Anwendung biostatistischer Verfahren in der Ökologie, Verhaltens- und Evolutionsbiologie: Grundlegende Konzepte, Datenverteilungen, Versuchsdesign, parametrische und nicht-parametrische Testverfahren, Allgemeine Lineare Modelle, Einführung in Datenauswertung und Darstellung mittels Statistikprogrammen (z.B. „R“)
Zusätzliche Informationen:
Modulprüfung: E-Klausur über die Inhalte der Vorlesung und Übung (1 Stunde, 2 Durchgänge)
Klausurtermin: Mi., 23.09.2020, 09.00-12.00 Uhr, mehrere PC-Räume (SB-ANT, HS-ANT, N33, P206)
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